स्कूली शिक्षा के बाद उच्च-शिक्षा के लिए विश्वविद्यालय स्तर तक पढ़ाई करवाई जाती है और योग्यता अनुसार उन्हें टीचर ट्रेनिंग देकर कलगीधर ट्रस्ट द्वारा चलाए जा रहे स्कूलों में अध्यापक के तौर पर नियुक्ति की जाती है। यह संतों की दूरदर्शी सोच थी कि एक पढ़ी लिखी औरत ही घर को सुचारु रूप से चला सकती है। एक लड़की को पढ़ाने का मतलब है एक पूरे परिवार को पढ़ाना। और उसका परिणाम समाज सुधार जो कि आज के समय की आवश्यकता है। इतना ही नहीं, अब लड़कियों के लिए मुफ्त उच्च शिक्षा पर भी जोर दिया जा रहा है। आज एक पिछड़े ग्रामीण क्षेत्र की लड़की भी विदेश जाकर अपने सपनों को पूरा करने की हकदार है। इसलिए संस्थान इन लड़कियों को नि:शुल्क आई.ई.एल.टी.एस. (IELTS) ट्रेनिंग भी दे रहा है।
इस संस्थान में लड़कियों को दो खंडों में बांटा जाता है:
प्रारंभिक कोर्स: आध्यात्मिक शिक्षा, अंग्रेजी भाषा में निपुणता, 10+1, 10+2 इटर्नल विश्वविद्यालय: B.A. (Hons.) Music, B.A. Humanities, B.Ed., M.A. Music, M.A. Punjabi, M.A. इंग्लिश, इटर्नल विश्वविद्यालय के संगीत विभाग में केवल अकाल ग्रामीण महिला सशक्तिकरण संस्थान की लड़कियां ही हैं। इन सभी कोर्सों का खर्चा कलगीधर ट्रस्ट बडू साहिब की ओर से किया जाता है।अभी तक सैकडो लडकीया इस सुविधा का लाभ उठा चुकी है ।